Моделі хвороб - імпульси

Імпульси моделі захворювань

Аскохітоз

Життєвий цикл

Патоген зимує на інфікованих рослинних рештках та насінні. Інфіковане насіння може відігравати важливу роль як у занесенні аскохітозу на нові території, так і на ранніх стадіях розвитку хвороби, оскільки збудник легко передається від насіння до проростків. На рослинних рештках можуть утворюватися як безстатеві спори (конідії, що поширюються дощовими бризками), так і статеві спори (аскоспори, що поширюються вітром). Пізньої осені та ранньої весни в результаті статевого розмноження утворюються псевдотеції, в яких містяться аскоспори. Розвиток псевдотеціїв триває п'ять-сім тижнів за достатньої вологості та помірних температур (близько 10°C).

Навесні та на початку літа зрілі псевдотеції вивільняють у повітря аскоспори, які можуть поширюватися на кілька миль і заражати цільові культури. Вважається, що аскоспори, які переносяться повітрям, є початковим джерелом інфекції навесні, хоча конідії, що потрапляють з дощем, також можуть бути залучені до цього процесу. Після зараження спорами симптоми починають розвиватися протягом чотирьох-шести днів. Ранні ураження мають відтінок від коричневого до темно-коричневого, з темно-коричневим краєм. Через три-шість днів після утворення уражень розвиваються темно-коричневі пікніди.

Пікніди часто розташовані концентричними кільцями і не стираються, як тканиноподібні уламки. Конідії сочаться з пікнід у вигляді липкої спорової маси і поширюються дощовими бризками на здорові частини рослини, спричиняючи нові інфекції.

Аскохітозна гниль

Більшість уражень під час вегетації є наслідком швидкого розвитку пікнід та конідій у вологих умовах. Навіть невеликих дощів достатньо, щоб конідії поширилися на нові рослинні тканини. Тому хвороба називається поліциклічною, тобто кілька циклів інфікування можуть відбуватися протягом вегетаційного періоду за достатньої вологості та температури (від 20 до 25°C).

Модель захворювання

Ми моделюємо розвиток пікнід та конідій під час вегетації.

Розвиток аскохітозу оптимальний за температури від 20 до 21°C (діапазон температур від 4°C до 34°C) та вологих умов (висока відносна вологість та вологість листя).

У моделі реалізовано два етапи циклу хвороби: 1. спороношення (розвиток пікнід, вивільнення конідій), тобто утворення нових інфекційних одиниць, і 2. оптимальні умови для подальшого інфікування цих конідій. Таким чином, для інфікування нових рослинних тканин спочатку були створені оптимальні умови для спороношення (100%), а потім крива інфікування досягла 100%.

Зернобобові Аскохітозна гниль

Завдяки оптимальним умовам (вологість листя, висока відносна вологість і температура близько 15°C протягом тривалого часу) спороношення пікнід було визначено 13 травня о 20:00 (синя лінія, 100%). Умови все ще були оптимальними для початку розвитку інфекції (червона лінія), а оптимальні умови для зараження були визначені 14 травня о 8:00 ранку (досягнуто 100%). Отже, залежно від стратегії захисту рослин, профілактичні заходи повинні були бути враховані вже до того, як відбулося зараження, або при застосуванні лікувальних заходів незабаром після того, як було визначено інфекцію (100%).

Література:

Сіра пліснява

Botrytis cinerea це некротрофний грибок, який вражає багато видів рослин, хоча його найпоширенішим господарем може бути виноград.
У виноградарстві вона широко відома як гронова гниль ботритис; у садівництві її зазвичай називають сірою пліснявою або сірою гниллю.
Грибок викликає два різних типи інфекцій на винограді. Перший, сіра гниль, є наслідком постійно вологих або сирих умов і, як правило, призводить до втрати уражених грон. Другий, благородна гниль, виникає, коли більш сухі умови змінюються більш вологими, і може призвести до появи характерних солодких десертних вин, таких як Сотерн або Асу з Токаю. Назва виду Botrytis cinerea походить від латинського "виноград, схожий на попіл"; хоча "виноград" - це поетичне слово, воно вказує на скупчення спор гриба на його конідієносцях, а "попіл" - лише на сіруватий колір спорових мас. Гриб зазвичай називають анаморфою (нестатевою формою), оскільки статева фаза спостерігається рідко. Телеоморф (статева форма) - це аскоміцет, Botryotinia cinerea.

Біологія B. cinerea

Виноградно-сіра пліснява

На епідеміологію сірої гнилі у фруктах і винограді великий вплив мають інфекції квіток, що протікають латентно. Можна виділити кілька шляхів зараження від квітки до плоду. У винограді, ківі, малині припускають інфікування через плодоніжку в зав'язь. В яйцеклітині патоген залишається латентним, що, мабуть, є результатом попередньо відформатованої стратегії захисту хазяїна (подібно до вмісту ресвератролу в молодих ягодах винограду). У винограду, ківі та полуниці важливе значення має інфікування через тичинку, пелюстки або чашолистки. У винограді дослідження показали, що B. cinerea може інфікувати тичинки і росте прикоренево, щоб інфікувати квітколоже, а потім системно проростає до плодоніжки і судинних тканин у ягодах.

Сіра пліснява у винограді

6-річний дослідницький проект у Капській провінції показав, що ягоди винограду можуть бути інфіковані через стому і сочевички плодоніжки, а також нижню частину рахісу. Інфекції плодоніжки можливі і в період цвітіння. Пізніше ця тканина підвищує стійкість до B. cinerea інфекції.

Інші шляхи зараження постулюють сапрофітний ріст збудника на квіткових рештках і пізніше зараження ягід, коли сприйнятливість зростає з дозріванням, або через пошкодження ягід комахами чи градом. Іншою тезою є припущення про накопичення конідій всередині плодів протягом літа і зараження сприйнятливих ягід пізніше в сезоні. Конідіальне зараження плодів, що дозрівають, можливе з будь-якого джерела інокуляту. Швидше за все, утворюється невелика кількість латентно інфікованих ягід, які демонструють екстенсивне спороношення, коли сприйнятливість ягід зростає з дозріванням. Можна припустити, що ягоди стають сприйнятливими, починаючи з вмісту цукру 6%.

У плодах ківі ми спостерігаємо великий вплив умов збирання на виникнення B. cinerea. Плоди, зібрані з вологої поверхні, можуть заразитися B. cinerea на мікропошкодженнях, залишених пальцями збирачів.

У практичному контролі за B. cinerea ми повинні відокремити два важливих періоди інфікування: Цвітіння та старіння. 1) Під час цвітіння ми маємо сприйнятливі молоді плоди, де інфекція супроводжується латентним періодом. 2) У той час як інфекція на зрілих (старіючих) плодах призводить до появи симптомів без латентного періоду. Важливість інфекції під час цвітіння винограду може змінюватися від сезону до сезону і від регіону до регіону. У фруктах, які повинні зберігатися певний час (столовий виноград, ківі або полуниця), симптоми проявляються при зберіганні в охолоджених умовах в магазинах або сховищах. Хімічний контроль винограду, що демонструє хорошу стійкість до B. cinerea під час цвітіння не дасть жодних економічних результатів. Тому всі умови ризику та ймовірності зараження, сприйнятливість плодів та термін придатності, умови зберігання повинні бути враховані при прийнятті рішення щодо заявки проти Botrytis cinerea під час цвітіння.

При зараженні кісточкових плодів B. cinerea відбувається переважно під час цвітіння. У цей час обробки проти Monilina spp. беруться до уваги, які також впливають на Botrytis cinerea інфекція.

Модель B. cinerea та практичне використання

Потрібні датчики: Вологість листя, температура, відносна вологість
Botrytis cinerea є факультативним паразитом. Він росте і на мертвому рослинному матеріалі. Через це він завжди присутній у виноградниках і садах. Botrytis cinerea пов'язана з вологим кліматом. Для зараження йому потрібна дуже висока відносна вологість або наявність вільної води (датчик: вологість листя, відносна вологість). Гриб не здатний інфікувати спорами здоровий дорослий рослинний матеріал. Зараження відбувається на молодих пагонах лози під час тривалих вологих періодів або на пагонах, пошкоджених градом.
Модель використовує наступну кореляцію між тривалістю вологості листя та температурою для розрахунку ризику інфекції.

вологість листя-тривалість_сіра пліснява_виноград

У "The Ботритис Модель ризику дає значення ризику від 0 до 100%. Це значення вказує на тиск B. cinerea на той час. Якщо ми маємо значення 100%it, це означає, що кілька разів був період вологості, достатній для інфікування сприйнятливої тканини (ми обчислюємо так звані "вологі точки" (масив між вологістю листя, температурою з максимумом спочатку 38400 точок (початок сезону, який відображає ризик 30%). Після цього періоду кожен вологий період з приблизно 4000 вологих точок (масив) збільшує ризик до 10% або, з іншого боку, кожен сухий період зменшує ризик на 1/5 від попереднього значення. Заявка проти
Заява проти B. cinerea залежить від фруктів та виробничих цілей.

graph4-viticulture

Склеротиніозна гниль

Склеротиніозна гниль вражає широкий спектр рослин, особливо недеревні види. Склеротиніозна гниль викликається S. sclerotiorum. Склеротиніозна гниль може вражати рослини на будь-якій стадії виробництва, включаючи розсаду, зрілі рослини та зібрану продукцію. Рослини зі старіючими або відмерлими тканинами особливо сприйнятливі до інфекції.

Симптоми

Заражена ділянка рослини спочатку набуває темно-зеленого або коричневого кольору, потім може стати блідішою. Зазвичай розвивається щільна біла ватоподібна грибниця, рослина починає в'янути і врешті-решт гине. Структури спокою або виживання (склероції) утворюються зовні на уражених частинах рослини і всередині в порожнинах серцевини стебла. Склероції тверді, чорні, неправильної форми, переважно 2-4 мм завбільшки, їх важко побачити, коли вони заглиблюються в ґрунт.

Джерела та поширення хвороби

Життєвий цикл S. sclerotiorum включає як ґрунтову, так і повітряну фазу. Склероції S. sclerotiorum можуть виживати в ґрунті десять і більше років. Вони проростають, утворюючи невеликі воронкоподібні плодові тіла (апотеції) діаметром приблизно 1 см. Апотеції утворюють спори, які переносяться повітрям і можуть викликати інфекцію, коли потрапляють на сприйнятливу рослину-господаря через квіти або безпосередньо проростають на листках. Іноді може відбуватися інфікування основи стебла, коли грибкові нитки (міцелій) розвиваються безпосередньо зі склероціїв біля поверхні. Нові склероції розвиваються в інфікованій рослинній тканині, і коли рослина гине, вони залишаються на поверхні ґрунту або можуть бути заглиблені під час подальшого обробітку ґрунту.

Умови для зараження

Після періоду холодної зими склероції, що зимують у верхніх 5 см ґрунту, проростають навесні, утворюючи апотеції, коли температура ґрунту становить 10°C або вище, а ґрунт вологий. Склероції не проростають у сухому ґрунті або при температурі вище 25°C. Склероції, заглиблені в ґрунт на глибину менше 5 см, мають менше шансів прорости. Після того, як апофеції повністю сформовані, вивільнення спор може відбуватися як на світлі, так і в темряві, але залежить від температури, тому має тенденцію до піку близько полудня. Апотеції можуть зберігатися близько 20 днів при температурі 15-20°C, але при 25°C зморщуються менш ніж через 10 днів. На квітучих травах спори, що потрапляють на пелюстки і тичинки, швидко проростають (проростання протягом 3-6 годин і зараження протягом 24 годин) в оптимальних умовах 15-25°C, постійного зволоження листя і високої вологості всередині культури. Подальше інфікування листя і стебел залежить від того, як пелюстки опадають і налипають на листя. Ризик зараження збільшується, якщо листя вологе, оскільки це призводить до прилипання більшої кількості пелюсток. Заражені мертві або старіючі пелюстки забезпечують поживні речовини для проникнення грибка в листя і стебла. Для неквітучих трав зараження відбувається переважно повітряно-крапельним шляхом, коли спори потрапляють безпосередньо на листя. Спори можуть виживати на листках протягом декількох тижнів, поки не настануть умови, сприятливі для зараження листя. Проростання спор і зараження залежать від наявності поживних речовин на листках, які надходять з ран рослин або зі старіючого рослинного матеріалу. Для квітучих трав оптимальними умовами для проростання спор та інфікування є 15-25°C при постійному зволоженні листя та високій вологості повітря. Після зараження рослин швидкому прогресуванню хвороби сприяють теплі (15-20°C) і вологі умови в густих посівах.

Модель інфекції склеротинії

Карпогенне проростання склероціїв стимулюється періодами тривалого зволоження ґрунту. На поверхні ґрунту утворюються апотеції, з яких аскоспори вивільняються у повітря. Інфекція більшості видів сільськогосподарських культур в основному пов'язана з аскоспорами, але прямого зараження здорової, неушкодженої рослинної тканини від проростаючих аскоспор, як правило, не відбувається. Натомість, інфікування тканин листя і стебла здорових рослин відбувається лише тоді, коли проростаючі аскоспори колонізують мертві або старіючі тканини, як правило, частини квіток, такі як обірвані пелюстки, до формування інфекційних структур і проникнення в них. Міцеліогенне проростання склероціїв на поверхні ґрунту також може призвести до колонізації мертвої органічної речовини з подальшим зараженням прилеглих живих рослин. Однак у деяких культурах, наприклад, соняшнику, міцеліогенне проростання склероціїв може безпосередньо ініціювати процес інфікування коренів і прикореневої частини стебла, що призводить до в'янення. Стимул для міцеліального проростання та інфікування соняшника невідомий, але, ймовірно, залежить від поживних сигналів у ризосфері, що надходять від рослин-господарів.

Процес зараження
Інфікування здорової тканини залежить від утворення апперсоніуму, який може бути простим або складним за структурою, залежно від поверхні хазяїна. У більшості випадків проникнення відбувається безпосередньо через кутикулу, а не через продихи. Аппресорій розвивається з кінцевого дихотомічного розгалуження гіф, що ростуть на поверхні хазяїна, і складається з подушечки широких, багатосепарованих, коротких гіф, орієнтованих перпендикулярно до поверхні хазяїна, до якої вони прикріплені за допомогою слизу. Складні аппресорії часто називають інфекційними подушками. Хоча раніше дослідники вважали проникнення крізь кутикулу суто механічним процесом, ультраструктурні дослідження переконливо свідчать про те, що ферментативне перетравлення кутикули також відіграє певну роль у процесі проникнення. Мало відомо про S. sclerotiorum кутинази, проте геном кодує щонайменше чотири кутиназоподібні ферменти (Hegedus неопублікована). Велика везикула, сформована на кінчику аппрессориума перед проникненням, вивільняється в кутикулу хазяїна під час проникнення. Після проникнення в кутикулу утворюється підкутикулярний пухирець, з якого віялом розростаються великі гіфи, які розчиняють підкутикулярну стінку епідермісу.

Зараження шляхом ферментативної деградації епідемічних клітин: Щавлева кислота взаємодіє з ферментами, що руйнують клітинну стінку, такими як полігалактуроназа (PG), і призводить до руйнування тканини хазяїна, створюючи середовище, сприятливе для атаки PG на пектин у середній ламелі. Це, в свою чергу, вивільняє низькомолекулярні похідні, які індукують експресію додаткових генів PG. Дійсно, загальна активність PG індукується пектином або похідними пектину моносахаридами, такими як галактуронова кислота, і пригнічується за наявності глюкози. Вивчення особливостей експресії окремих генів Sspg показало, що взаємодія між PG та хазяїном на різних стадіях інфекції є тонко скоординованою. (Dwayne D. Hegedus *, S. Roger Rimmer: Sclerotinia sclerotiorum: Коли "бути чи не бути" патогеном? Мікробіологічні листи FEMS 251 (2005) 177-184)

Шукаючи кліматичні умови для інфікування S. sclerotiorum, слід враховувати формування апотеціїв, спороношення, пряме інфікування апотеціями (навіть якщо це відбувається не дуже часто) та інфікування від сформованих міцеліїв шляхом ферментативної деградації епідемічних клітин.

Утворення та спороношення апотеціїв відбувається, якщо після дощу більше 8 мм настає період високої відносної вологості, що триває більше 20 годин при оптимальній температурі від 21°C до 26°C.

Пряме зараження апотеціями можна очікувати після періоду зволоження листя з наступним 16-годинним періодом відносної вологості, вищою за 90%, при оптимальній температурі від 21°C до 26°C ("аппресорна інфекція"). Тоді як сапрофітний ріст з подальшою ферментативною деградацією клітин епідермісу ("гідролітична інфекція") можна очікувати при дещо нижчій відносній вологості 80% протягом 24 годин в оптимальних умовах від 21°C до 26°C.

Література:

  • Ламсден, Р.Д. (1976) Пектолітичні ферменти Sclerotinia sclerotiorum та їх локалізація на заражених бобах. Can. J. Bot. 54,2630-2641.
  • Тарік, В.Н. и Джефріс, П. (1984) Формування аппрессориума у Sclerotinia sclerotiorum: скануюча електронна мікроскопія. Trans. Brit. Mycol. Soc. 82, 645-651.
  • Бойль, К. (1921) Дослідження з фізіології паразитизму. VI. Зараження Sclerotinia libertiana. Ann. Bot. 35, 337-347.
  • Абаві, Г.С., Полач, Ф.Д. і Молін, В.Т. (1975) Інфекція квасолі аскоспорами Whetzelinia sclerotiorum. Фітопатологія 65, 673-678.
  • Тарік, В.Н. і Джефріс, П. (1986) Ультраструктура проникнення Phaseolus spp. у Sclerotinia sclerotiorum. Can. J. Bot. 64, 2909- 2915.
  • Марчіано, П., Ді Ленна, П. і Магро, П. (1983) Щавлева кислота, ферменти, що руйнують клітинну стінку, і рН у патогенезі та їх значення у вірулентності двох ізолятів Sclerotinia sclerotiorum на соняшнику. Physiol. Plant Pathol. 22, 339-345.
  • Фрейсіне-Таше, Л. та Февре, М. (1996) Регуляція галактуроновою кислотою продукції пектонолітичного ферменту Sclerotinia sclerotiorum. Curr. Microbiol. 33, 49-53.

Практичне використання моделі склеротинії

Модель інфекції білої ніжки показує періоди, коли очікується утворення апотеціїв. Якщо ці періоди збігаються з періодом цвітіння насіння ріпаку або каноли, слід очікувати S. sclerotiorum інфекції у вологий період. Спори, що утворюються в апотеціях, можуть бути доступними від одного до декількох днів. На можливість зараження вказує розрахунок розвитку інфекції для прямого або непрямого зараження шляхом аппресорії або ферментативної деградації клітинної стінки. Якщо лінія розвитку інфекції досягає 100%, слід припустити наявність інфекції. Ці інфекції повинні бути покриті профілактичним препаратом або фунгіцидом з лікувальною дією проти S. sclerotiorum має бути використана.

TomCast Alternaria

TOMCAST (TOMato disease foreCASTing) - це комп'ютерна модель, заснована на польових даних, яка намагається передбачити розвиток грибкових захворювань, а саме раннього фітофторозу, септоріозу листя та антракнозу на томатах. Польові реєстратори даних щогодини записують дані про вологість і температуру листя. Ці дані аналізуються протягом 24 годин і можуть призвести до формування показника тяжкості хвороби (Disease Severity Value, DSV); по суті, це приріст розвитку хвороби. По мірі накопичення DSV, тиск хвороби на культуру продовжує зростати. Коли кількість накопичених DSV перевищує інтервал між обприскуваннями, рекомендується застосувати фунгіцид, щоб зменшити тиск хвороби.

TOMCAST походить від оригінальної моделі F.A.S.T. (Forecasting Alternaria solani on Tomatoes), розробленої докторами Медденом, Пенніпекером та Макнабом в Університеті штату Пенсильванія (PSU). Модель PSU F.A.S.T. була надалі модифікована доктором Пітбладо в коледжі Ріджтаун в Онтаріо в те, що ми зараз визнаємо як модель TOMCAST, яка використовується Extension University of Ohio State University. DSV - це: Значення тяжкості захворювання (DSV) це одиниця виміру конкретного кроку розвитку хвороби (раннього фітофторозу). Іншими словами, DSV - це числове представлення того, наскільки швидко або повільно хвороба (ранній фітофтороз) накопичується на томатному полі. DSV визначається двома факторами; вологість листя та температура в години "мокрого листя". Зі збільшенням кількості годин зволоження листя та температури DSV накопичуються швидше. Нижче наведено діаграму "Тяжкість хвороби".

І навпаки, за меншої кількості годин зволоження листя та нижчої температури DSV накопичуються повільніше, якщо взагалі накопичуються. Коли загальна кількість накопичених DSV перевищує встановлену межу, яка називається інтервалом або порогом обприскування, рекомендується обприскування фунгіцидом, щоб захистити листя і плоди від розвитку хвороб.

У "The інтервал обприскування Інтервал між обприскуваннями (який визначає, коли слід обприскувати) може коливатися в межах 15-20 DSV. Точне значення DSV, яке повинен використовувати виробник, зазвичай надається переробником і залежить від якості плодів і кінцевого використання томатів. Дотримання інтервалу обприскування 15 DSV є консервативним використанням системи TOMCAST, тобто ви будете обприскувати частіше, ніж фермер, який використовує інтервал обприскування 19 DSV з системою TOMCAST. Компроміс полягає в кількості обприскувань протягом сезону і потенційній різниці в якості плодів.

В Університеті штату Мічиган розпочато дослідження з тестування системи прогнозування хвороб TomCast для використання в боротьбі з фітофторозом моркви. TomCast вже використовується на комерційній основі у виробництві томатів, а нещодавно була адаптована для використання в управлінні хворобами спаржі. Переробну моркву сорту "Раннє золото" висаджували вакуумною сівалкою точного висіву на дослідній фермі МДУ на гнойових ґрунтах у три ряди на відстані 18 дюймів один від одного на піднятому грядці довжиною 50 футів. Грядки моркви були розміщені на відстані 64 дюйми, а відстань між насінням у рядку становила 1 дюйм. Кожна з чотирьох повторностей експерименту була розташована в окремих блоках моркви, які складалися з 36 грядок. Сімнадцять оброблюваних грядок довжиною 20 футів були випадковим чином розміщені в шаховому порядку в кожній повторності. Обробку проводили за допомогою ранцевого обприскувача CO2, який був відкалібрований для подачі 50 галонів на акр розчину за допомогою 8002 плоских вентиляторних насадок. Обробка складалася з необробленого та різних графіків застосування Bravo Ultrex 82.5WDG (22,4 унції/га), що чергувалися з Quadris 2.08SC (6,2 фл. унції/га). Хімічну програму застосовували за 10-денною календарною програмою, а також за прогнозом прогнозиста хвороб TomCast. Для визначення часу застосування фунгіцидів використовувалися три різні прогнозні пороги: 15, 20 і 25 DSV. Коли кумулятивні щоденні значення DSV досягали визначеного порогу, розпочиналося обприскування. Кожен режим обробки розпочинався за чотирьох різних рівнів розвитку хвороби (0%, сліди, 5% та 10% листкова гниль). Першу обробку було проведено 2 липня, а останню - 21 вересня. Десять футів кожного центрального ряду блоків обприскувачів були промарковані перед першим застосуванням і використовувалися для щотижневих оцінок хвороб (див. графіки нижче). Врожайність збирали з однієї і тієї ж десятифутової ділянки рядка шляхом ручного збирання моркви, перебирання та зважування.

Це свідчить про те, що Першу обробку моркви слід проводити, як тільки ми зможемо виявити перші ознаки захворювання на полі. Відтепер він працював нормально, використовуючи модель TomCast з поріг 20 DSV що накопичилися з моменту останнього обприскування.

Клімат поля визначає тяжкість інфекції альтернаріозу в двох різних моделях:

Джерело: Джим Ясінські, координатор TOMCAST в Огайо, Індіані та Мічигані

Рекомендоване обладнання

Перевірте, який набір датчиків потрібен для моніторингу потенційних хвороб цієї культури.